Обучение юных железнодорожников осуществляется по дополнительным общеразвивающим программам. Полный курс освоения программ составляет 7 лет и предусматривает обучение по двум ступеням: I – ступень – 5-9 класс (1-5 курс); II – ступень – 10-11 класс (6-7 курс).
Обучение юных железнодорожников на линейных станциях проводится на базе школ, а в городе Свободном – на базе Учебного центра Свободненской детской железной дороги.
В Учебном центре оборудованы классы для изучения железнодорожных профессий и дисциплин:
- общий курс железных дорог;
- хозяйство движения»;
- путевое хозяйство (с действующими макетами обыкновенный одиночный стрелочный перевод, ограждение места производства работ, регулируемый охраняемый железнодорожный переезд);
- вагонное хозяйство;
- охрана труда;
- компьютерный класс (с имитационным тренажером ДСП/ДНЦ, интеллектуальной обучающей системой «Нестандартные ситуации» (ИОС-Д) и автоматизированной обучающей системой для оперативного персонала хозяйства перевозок (АОС-ДМ);
- локомотивное хозяйство (с тренажером машиниста тепловоза ТУ-10).
В 2021 году Свободненской детской железной дороге присвоено имя первого министра путей сообщения РФ, первого президента ОАО «РЖД» Геннадия Матвеевича Фадеева.